Từ cơ sở thẩm tra, xác minh của Thanh tra tỉnh, UBND tỉnh có kết luận như sau: Thửa đất mà ông Đinh Văn Tân chiếm sử dụng và đang khiếu nại là đất trồng cây phi lao do UBND phường Phú Đông quản lý. Tuy nhiên, do địa phương quản lý không chặt chẽ, nên sau năm 2007 ông Đinh Văn Tân đã chiếm sử dụng và xây dựng nhà ở trái phép trên diện tích đất này. Căn cứ Khoản 2 Điều 45 Nghị định số 84/2007/NĐ-CP ngày 25/5/2007 của Chính phủ, quy định: “Đất do lấn, chiếm và đất được giao, được cho thuê không đúng thẩm quyền kể từ ngày 01 tháng 7 năm 2004 trở về sau thì người có hành vi lấn, chiếm hoặc được giao đất, thuê đất không đúng thẩm quyền không được bồi thường về đất khi thu hồi đất”; Căn cứ Khoản 7 Điều 9 Quyết định 471/2010/QĐ-UBND ngày 16/3/2010 của UBND tỉnh Phú Yên, quy định: “Nhà, công trình khác xây dựng trên đất không đủ điều kiện được bồi thường về đất theo quy định tại Điều 8 Nghị định số 197/2004/NĐ-CP và xây dựng từ ngày 01/7/2004 về sau, mà khi xây dựng vi phạm quy hoạch, kế hoạch sử dụng đất được cấp có thẩm quyền công bố, cắm mốc hoặc vi phạm hành lang bảo vệ công trình đã được cắm mốc thì không được bồi thường, hỗ trợ, người có công trình xây dựng buộc phải tháo dỡ hoặc chịu chi phí tháo dỡ trong trường hợp cơ quan có thẩm quyền thực hiện tháo dỡ” thì việc ông Đinh Văn Tân yêu cầu bồi thường về đất, nhà cửa, vật kiến trúc trên đất là không có cơ sở để giải quyết.

Tuy nhiên, để tạo điều kiện hỗ trợ cho các hộ dân bị ảnh hưởng bởi dự án, ngày 04/10/2011, UBND tỉnh Phú Yên có Thông báo số 703/TB-UBND kết luận họp bàn giải quyết vướng mắc trong công tác bồi thường, hỗ trợ và tái định cư Tiểu dự án 2: Đường từ nam cầu Hùng Vương đến Khu Công nghiệp Hòa Hiệp 1 cho phép UBND thành phố Tuy Hòa giao đất tái định cư cho các hộ dân bị ảnh hưởng bởi dự án theo hướng chậm nộp tiền sử dụng đất theo Nghị định số 120/2010/NĐ-CP ngày 30/12/2010 của Chính phủ về sửa đổi, bổ sung một số điều của Nghị định số 198/2004/NĐ-CP ngày 03 tháng 12 năm 2004 của Chính phủ về thu tiền sử dụng đất và ngày 03/8/2012, UBND Tỉnh có Thông báo 504/TB-UBND điều chỉnh nội dung Thông báo 703/TB-UBND của UBND tỉnh. Ngoài ra, ngày 10/02/2012 UBND tỉnh Phú Yên có Công văn số 250/UBND-ĐTXD về việc xác định lộ giới, hỗ trợ và tái định cư Tiểu dự án 2, 3, cụ thể: “Đối với 15 hộ xây dựng nhà, vật kiến trúc trước ngày 01/7/2004 bị lập biên bản vi phạm hành chính và các hộ xây dựng nhà, vật kiến trúc sau ngày 01/7/2004, để tạo điều kiện cho người dân di chuyển và ổn định chỗ ở, hỗ trợ từ 13.000.000-15.000.000 đồng/hộ”. Mặt khác, ngày 02/7/2012 UBND tỉnh Phú Yên có Công văn số 1866/UBND-ĐTXD điều chỉnh mức bồi thường, hỗ trợ cho các đối tượng bị giải toả của Tiểu dự án 2, cụ thể: “Hỗ trợ 40 triệu đồng/hộ (thay cho mức hỗ trợ 15 triệu đồng/hộ trước đây) đối với 7 hộ xây dựng nhà, vật kiến trúc trước ngày 01/7/2004 bị lập biên bản vi phạm hành chính; Hỗ trợ 30 triệu đồng/hộ (thay cho mức hỗ trợ 15 triệu đồng/hộ trước đây) đối với 7 hộ xây dựng nhà, vật kiến trúc sau ngày 01/7/2004, để di chuyển và ổn định chỗ ở”.

Như vậy, việc xem xét hỗ trợ cho hộ ông Đinh Văn Tân đã thể hiện sự quan tâm của địa phương và UBND thành phố Tuy Hoà đã xem xét hỗ trợ cho ông Tân 30.000.000 đồng và bồi thường cây cối, hoa màu 110.000 đồng. Tổng số tiền bồi thường, hỗ trợ đối với hộ ông Tân là 30.110.000 đồng.

Thực hiện Điều 39 Luật khiếu nại năm 2011 quy định về tổ chức đối thoại lần hai, Chủ tịch UBND tỉnh đã uỷ quyền cho Chánh Thanh tra tỉnh tổ chức đối thoại theo quy định của pháp luật. Ngày 15/01/2013, Thanh tra tỉnh tổ chức đối thoại, với sự tham gia: Chánh thanh tra tỉnh, Đoàn xác minh, đại diện Lãnh đạo Sở Tài nguyên và Môi trường; đại diện UBND thành phố Tuy Hòa; đại diện UBND phường Phú Đông và bà Nguyễn Thị Mực (được ông Đinh Văn Tân ủy quyền). Tại buổi đối thoại, Chánh Thanh tra tỉnh công bố kết quả xác minh và kết luận việc khiếu nại của ông Đinh Văn Tân là không có cơ sở giải quyết nhưng bà Mực vẫn không đồng ý việc Nhà nước không bồi thường về đất, nhà cửa, vật kiến trúc trên đất.

Từ những cơ sở trên, UBND tỉnh không công nhận nội dung đơn khiếu nại đề ngày 02/11/2012 của ông Đinh Văn Tân, vì không có cơ sở pháp luật.

Đồng thời UBND tỉnh công nhận nội dung Quyết định giải quyết khiếu nại số 4488/QĐ-UBND ngày 09/10/2012 của Chủ tịch UBND thành phố Tuy Hòa, là có cơ sở pháp luật. Đây là Quyết định giải quyết khiếu nại lần hai. Nếu không đồng ý với Quyết định này, ông Đinh Văn Tân có quyền khởi kiện theo quy định của pháp luật.